MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema succinifaciens DSM 2489 chromosome

Total Repeats: 52760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015385	ATG	2	6	82	87	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328946931
2	NC_015385	AGA	2	6	146	151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328946931
3	NC_015385	TA	3	6	279	284	50 %	50 %	0 %	0 %	328946931
4	NC_015385	A	6	6	288	293	100 %	0 %	0 %	0 %	328946931
5	NC_015385	GAATCT	2	12	309	320	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	328946931
6	NC_015385	AAATGA	2	12	374	385	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	328946931
7	NC_015385	A	8	8	397	404	100 %	0 %	0 %	0 %	328946931
8	NC_015385	AGA	2	6	543	548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328946931
9	NC_015385	GGA	2	6	570	575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328946931
10	NC_015385	GAAAA	2	10	643	652	80 %	0 %	20 %	0 %	328946931
11	NC_015385	T	6	6	683	688	0 %	100 %	0 %	0 %	328946931
12	NC_015385	AGA	2	6	788	793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328946931
13	NC_015385	T	6	6	817	822	0 %	100 %	0 %	0 %	328946931
14	NC_015385	AGAC	2	8	905	912	50 %	0 %	25 %	25 %	328946931
15	NC_015385	A	7	7	989	995	100 %	0 %	0 %	0 %	328946931
16	NC_015385	A	6	6	1008	1013	100 %	0 %	0 %	0 %	328946931
17	NC_015385	AGA	2	6	1022	1027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328946931
18	NC_015385	A	6	6	1046	1051	100 %	0 %	0 %	0 %	328946931
19	NC_015385	ACA	2	6	1162	1167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328946931
20	NC_015385	TTCAAT	2	12	1187	1198	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	328946931
21	NC_015385	GTC	2	6	1215	1220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328946931
22	NC_015385	ACA	2	6	1231	1236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328946931
23	NC_015385	CAA	2	6	1268	1273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328946931
24	NC_015385	A	7	7	1272	1278	100 %	0 %	0 %	0 %	328946931
25	NC_015385	GCT	2	6	1347	1352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328946931
26	NC_015385	CGG	2	6	1358	1363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328946931
27	NC_015385	CAA	2	6	1375	1380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328946931
28	NC_015385	ACA	2	6	1393	1398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328946931
29	NC_015385	CAA	2	6	1438	1443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328946931
30	NC_015385	TCT	2	6	1448	1453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328946931
31	NC_015385	AG	3	6	1458	1463	50 %	0 %	50 %	0 %	328946931
32	NC_015385	AAG	2	6	1476	1481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328946931
33	NC_015385	AT	3	6	1776	1781	50 %	50 %	0 %	0 %	328946932
34	NC_015385	ATT	2	6	1837	1842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	328946932
35	NC_015385	CAA	2	6	1844	1849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328946932
36	NC_015385	A	6	6	1848	1853	100 %	0 %	0 %	0 %	328946932
37	NC_015385	TTA	2	6	1880	1885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	328946932
38	NC_015385	GAA	2	6	1966	1971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328946932
39	NC_015385	AAC	3	9	1974	1982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328946932
40	NC_015385	CTTC	2	8	2020	2027	0 %	50 %	0 %	50 %	328946932
41	NC_015385	GAA	2	6	2052	2057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328946932
42	NC_015385	TAA	2	6	2084	2089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328946932
43	NC_015385	A	7	7	2104	2110	100 %	0 %	0 %	0 %	328946932
44	NC_015385	CTT	2	6	2225	2230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328946932
45	NC_015385	A	6	6	2284	2289	100 %	0 %	0 %	0 %	328946932
46	NC_015385	GCC	2	6	2321	2326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328946932
47	NC_015385	GAA	2	6	2428	2433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328946932
48	NC_015385	TGT	2	6	2451	2456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328946932
49	NC_015385	TAG	2	6	2588	2593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328946932
50	NC_015385	TCT	2	6	2680	2685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328946932
51	NC_015385	GAA	2	6	2710	2715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328946932
52	NC_015385	GAG	2	6	2773	2778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328946932
53	NC_015385	A	6	6	2801	2806	100 %	0 %	0 %	0 %	328946932
54	NC_015385	AGA	2	6	2823	2828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328946932
55	NC_015385	ATT	2	6	2867	2872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	328946932
56	NC_015385	ATA	2	6	2878	2883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328946932
57	NC_015385	A	6	6	2917	2922	100 %	0 %	0 %	0 %	328946933
58	NC_015385	TCTT	2	8	2930	2937	0 %	75 %	0 %	25 %	328946933
59	NC_015385	TCA	2	6	2985	2990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328946933
60	NC_015385	ATTT	2	8	2997	3004	25 %	75 %	0 %	0 %	328946933
61	NC_015385	A	6	6	3011	3016	100 %	0 %	0 %	0 %	328946933
62	NC_015385	TAT	2	6	3051	3056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	328946933
63	NC_015385	A	9	9	3104	3112	100 %	0 %	0 %	0 %	328946933
64	NC_015385	GAA	2	6	3147	3152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328946933
65	NC_015385	ATT	2	6	3177	3182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	328946933
66	NC_015385	AAAAG	2	10	3185	3194	80 %	0 %	20 %	0 %	328946933
67	NC_015385	A	7	7	3198	3204	100 %	0 %	0 %	0 %	328946933
68	NC_015385	AGAA	2	8	3308	3315	75 %	0 %	25 %	0 %	328946933
69	NC_015385	GTAT	2	8	3343	3350	25 %	50 %	25 %	0 %	328946933
70	NC_015385	A	6	6	3395	3400	100 %	0 %	0 %	0 %	328946933
71	NC_015385	A	7	7	3486	3492	100 %	0 %	0 %	0 %	328946933
72	NC_015385	AAAT	2	8	3593	3600	75 %	25 %	0 %	0 %	328946933
73	NC_015385	T	7	7	3620	3626	0 %	100 %	0 %	0 %	328946933
74	NC_015385	TGT	2	6	3653	3658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328946933
75	NC_015385	ATT	2	6	3661	3666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	328946933
76	NC_015385	A	6	6	3688	3693	100 %	0 %	0 %	0 %	328946933
77	NC_015385	AAG	2	6	3745	3750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328946933
78	NC_015385	A	6	6	3784	3789	100 %	0 %	0 %	0 %	328946933
79	NC_015385	T	6	6	3826	3831	0 %	100 %	0 %	0 %	328946933
80	NC_015385	GAT	2	6	3870	3875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328946933
81	NC_015385	TTC	2	6	3877	3882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328946933
82	NC_015385	A	6	6	3898	3903	100 %	0 %	0 %	0 %	328946933
83	NC_015385	TTC	2	6	3955	3960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328946933
84	NC_015385	GAA	2	6	4046	4051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328946934
85	NC_015385	TTTC	2	8	4056	4063	0 %	75 %	0 %	25 %	328946934
86	NC_015385	AAT	2	6	4069	4074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328946934
87	NC_015385	ATG	2	6	4131	4136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328946934
88	NC_015385	A	7	7	4142	4148	100 %	0 %	0 %	0 %	328946934
89	NC_015385	TTC	2	6	4171	4176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328946934
90	NC_015385	ATC	2	6	4257	4262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328946934
91	NC_015385	A	6	6	4292	4297	100 %	0 %	0 %	0 %	328946934
92	NC_015385	TA	3	6	4298	4303	50 %	50 %	0 %	0 %	328946934
93	NC_015385	A	6	6	4418	4423	100 %	0 %	0 %	0 %	328946934
94	NC_015385	A	8	8	4428	4435	100 %	0 %	0 %	0 %	328946934
95	NC_015385	CAA	2	6	4456	4461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328946934
96	NC_015385	A	6	6	4460	4465	100 %	0 %	0 %	0 %	328946934
97	NC_015385	TAA	2	6	4480	4485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328946934
98	NC_015385	A	7	7	4492	4498	100 %	0 %	0 %	0 %	328946934
99	NC_015385	A	8	8	4503	4510	100 %	0 %	0 %	0 %	328946934
100	NC_015385	TCC	2	6	4516	4521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328946934
101	NC_015385	TTA	2	6	4634	4639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	328946935
102	NC_015385	CGG	2	6	4713	4718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328946935
103	NC_015385	AGA	3	9	4735	4743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328946935
104	NC_015385	AAG	2	6	4780	4785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328946935
105	NC_015385	TCC	2	6	5242	5247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328946936
106	NC_015385	GTT	2	6	5268	5273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328946936
107	NC_015385	A	7	7	5418	5424	100 %	0 %	0 %	0 %	328946937
108	NC_015385	TTG	2	6	5460	5465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328946937
109	NC_015385	CAG	2	6	5504	5509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328946937
110	NC_015385	A	7	7	5545	5551	100 %	0 %	0 %	0 %	328946937
111	NC_015385	AGA	2	6	5629	5634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328946937
112	NC_015385	TAA	2	6	5659	5664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328946937
113	NC_015385	CGG	2	6	5689	5694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328946937
114	NC_015385	CTT	2	6	5714	5719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328946937
115	NC_015385	ATAAAG	2	12	5724	5735	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	328946937
116	NC_015385	TCTT	2	8	5794	5801	0 %	75 %	0 %	25 %	328946937
117	NC_015385	AT	3	6	5832	5837	50 %	50 %	0 %	0 %	328946937
118	NC_015385	A	7	7	5848	5854	100 %	0 %	0 %	0 %	328946937
119	NC_015385	AAGG	2	8	5993	6000	50 %	0 %	50 %	0 %	328946937
120	NC_015385	CTC	2	6	6045	6050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328946937
121	NC_015385	GGA	2	6	6113	6118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328946937
122	NC_015385	A	7	7	6118	6124	100 %	0 %	0 %	0 %	328946937
123	NC_015385	CTT	2	6	6216	6221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328946937
124	NC_015385	CTA	2	6	6255	6260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328946937
125	NC_015385	GATG	2	8	6275	6282	25 %	25 %	50 %	0 %	328946937
126	NC_015385	A	6	6	6394	6399	100 %	0 %	0 %	0 %	328946937
127	NC_015385	AAT	2	6	6469	6474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328946937
128	NC_015385	A	6	6	6492	6497	100 %	0 %	0 %	0 %	328946937
129	NC_015385	ATA	2	6	6530	6535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328946937
130	NC_015385	TTGTT	2	10	6558	6567	0 %	80 %	20 %	0 %	328946937
131	NC_015385	GCC	2	6	6584	6589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328946937
132	NC_015385	TTC	2	6	6633	6638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328946937
133	NC_015385	CAG	2	6	6659	6664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328946937
134	NC_015385	AAG	2	6	6696	6701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328946937
135	NC_015385	TTTG	2	8	6754	6761	0 %	75 %	25 %	0 %	328946937
136	NC_015385	GGAT	2	8	6818	6825	25 %	25 %	50 %	0 %	328946937
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